在jCloud上使用NTCHEM-MINI科研模板
NTCHEM-MINI 是一套软件的应用领域是量子化学,做分子电子结构计算。
创建模板
使用账号登录 jCloud,在左侧的菜单中单击“科研模板”标签,可以看到我们提供的所有科研模板。选择 NTChem-mini。
将鼠标移至模板的图标上,点击“立即创建”,会出现“创建应用”的页面。在这里定义您的模板名称,集群节点数目,每台云主机的登录密码,CPU 和内存的参数,硬盘的类型和大小,以及网络带宽和私有网络地址。
在“我的科研应用”标签中,可以看到所创建模板的状态。
等科研模板状态变成“创建完成”。
查看云主机列表可以查看新生成的模板主机,查看路由列表可以查看绑定了浮动 IP 的路由器,模板的所有节点可以通过该 IP 与外网进行通信。
使用
在“科研应用“的”我的科研应用“列表中单击刚创建的应用名称查看详情,在概览页面可以查看到远程访问主节点的方式。
工具安装在 /opt 目录下,主要包含 bin、config、platforms、src、tests 目录。
我们使用以下运行参数进行测试:1
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4
5cd /opt/ntchem-mini/tests/taxol
mpiexec -n 16 /opt/ntchem-mini/tests/rimp2.exe
也可直接
cd /opt/ntchem-mini/tests/taxol
/opt/ntchem-mini/tests/rimp2.exe
更多详细参数配置可以参考:
https://github.com/fiber-miniapp/ntchem-mini